Pemba, segunda isla del archipiélago en tamaño, está situada a 50 km de la isla de Zanzíbar. Es mucho más montañosa y está principalmente formada de rocas. Una superficie importante la ocupan pantanos y manglares. La población, unos 300.000 habitantes, es mucho más pobre que la de la isla vecina. Las actividades principales son la pesca y la agricultura. La mayoría de la producción tanzana de clavo de especia proviene de esta isla.